Final Fantasy XIII-2 tapahtumat sijoittuvat vähän aikaa Final Fantasy XIII:n päättymisen jälkeiseen aikaan. Fal’cien valtakausi päättyi kun Lightning tovereineen saivat tuhotuksi Orphanin. Cocoon oli törmäämässä Gran Pulseen, mutta Oerba Dia Vanille ja Oerba Yun Fang muuntuivat Ragnarokiksi estääkseen tämän. Näin ihmiset pääsivät muuttamaan asumaan Gran Pulseen. Pelot maailmasta olivat poissa, kun he lopulta pääsivät näkemään totuuden Pulsesta.
… aikaa meni ja Lightning halusi ryhtyä pelastamaan Fang ja Vanille kristallipilarista. Ei paljasteta kaikkea, jää sitten pelattavaakin..
Pelin taistelujärjestelmä tulee olemaan kehitetty versio Final Fantasy XIII:n Paradigm-systeemistä.