Pikminit pitävät Olimarin seuraamisesta ja ne myös työskentelevät kovasti. Napauta kosketusnäyttöä heittääksesi Pikminejä sinne, missä tarvitset niitä. Pikminit siirtävät kohtaamansa esineet, taistelevat vaarallisia eläimiä vastaan ja keräävät aarteita, joita tarvitset päästäksesi maaliin.
Kuten aina, punaiset Pikminit kestävät tulta, siniset Pikminit pitävät vedestä ja keltaisia Pikminejä voi heittää korkealle ja ne kestävät myös sähköä. Tulet kohtaamaan seikkailun aikana useita haastavia tehtäviä. Täydellinen seikkailu sinulle ja sinun kaikille Pikmineille.
Verrattuna aikaisempiin Pikmin-peleihin, jotka ovat keskittyneet enemmän tutkimiseen ja pulmanratkontaan, tämä on toimintapeli, jossa sinun täytyy ajatella nopeasti ja hyödyntää jokaisen käytössä olevan Pikminin kykyjä.