Edellisen Pikmin-pelin julkaisusta on ehtinyt kulua jo lähes kahdeksan vuotta. Peli sisältää uusia haasteita, uusia hahmoja ja salaperäisiä uusia Pikmin-hahmoja.
Nyt Pikmin-otuksia on nyt peräti kuutta erilaista, joista ensi esiintymisensä tekevät kivi-Pikminit.
Wii U -peliohjain luo uusia pelikokemuksia uudistamalla Nintendon reaaliaikaisen strategiapelisarjan ohjausjärjestelmän ja haastamalla pelaajia uusilla jännittävillä tavoilla. Pikmin 3 hyödyntää myös Wii U -pelilaitteen HD-ominaisuuksia kuvatakseen entistä yksityiskohtaisemmin luonnon maisemia, useita erilaisia olentoja sekä rakastettavia Pikmin-hahmoja.
Peliä pelataan uudella Wii U Gamepad-ohjaimen napeilla ja kosketusnäytöllä, mutta myös Wii Motea ja Nunchukia tuetaan.
