Saints Row:n tarina jatkuu jälleen täysin avoimessa pelimaailmassa Steelportin kaupungissa.
Tällä kertaa vastaan asettuu ennalta arvaamattomat avaruuden muukalaiset.
Samalla Saintsin pomon status on noussut kertalaakista Yhdysvaltain presidentiksi, jonka pitääkin laittaa muukalaiset ruotuun mahtavilla supervoimillaan.
Täysin päätön tarinankerronta jatkuu, kun herra presidentti joutuu varsin Matrixmaiseen tilanteeseen, jossa ihmiskunta on alistettu kytkemällä poppoota kiinni muukalaisten tietokonesimulaatioon.
Tämä lähtötilanne taas antaa sarjalle mahdollisuuden revitellä vielä kolmostakin asteen pidemmälle.
Teknohakkerointimagian avulla pelaaja voi juosta karkuun luoteja, keilata autoja tieltään, hyppiä korkeiden rakennusten yli tai ampua elementaalista vahinkoa käsistään.